Die Auswirkungen der zunehmenden Trockenheit und wärmeren Temperaturen in Brandenburg sind auch bei der Pflege der Kompensationsmaßnahmen deutlich spürbar. Sogenannter Trockenstress bei Gehölzen kann Schädlingsbefall begünstigen und auch Bäume können Sonnenbrand bekommen.
Reagiert wird darauf durch zusätzliches Wässern oder das Anbringen von schützenden Anstrichen. Als besonders herausfordernd zeigen sich Aufforstungen im Umland sowie der Waldumbau in der Zülowniederung. In einigen Flächen musste bereits mehrfach nachgepflanzt werden, wobei versucht wird, das Artenspektrum von gebietsheimischen Baumarten an die Herausforderungen des Klimawandels anzupassen. Auch die Feuchtwiesen und Salzstellen im Gebiet leiden unter der Trockenheit der letzten Jahre. Durch gezieltes Management der Staueinrichtung wird versucht, Wasser auf den Flächen zu halten.