Ziel der FBB ist es, mit den Kompensationsmaßnahmen einen nachhaltig positiven Umwelteinfluss zu erreichen. Dazu werden die Effekte der umgesetzten Naturschutzmaßnahmen von der Flughafengesellschaft langfristig beobachtet und seit 2013 durch ein fachliches Monitoring begleitet. Beim Monitoring werden jedes Jahr unterschiedliche Flächen untersucht, die Pflanzenarten und Biotope erfasst und auf dieser Grundlage die ökologische Entwicklung ausgewertet.
Bei den Kompensationsmaßnahmen gilt der Grundsatz: Je diverser Vegetation und Lebensräume in einem Gebiet sind, desto mehr Möglichkeiten haben Tierarten sich anzusiedeln. Und das gelingt, denn die jährlichen Untersuchungen der Brutvögel in der Zülowniederung zeigen seit Beginn der Maßnahmen im Jahr 2013, wie sich die Anzahl der Brutreviere im Laufe der Zeit mehr als verdoppelt hat. Dass die Anzahl der Vogelarten von Jahr zu Jahr variiert, ist vor allem auf regionale und klimatische Effekte zurückzuführen, auf die die FBB keinen Einfluss hat. Aber die von der FBB umgesetzten Kompensationsmaßnahmen schaffen von Jahr zu Jahr neuen Lebensraum für einheimische Vogelarten.